Комплексная реставрация Агатового кабинета началась в 2011 году. Одновременно начались работы велись в Библиотеке, стенам и потолку которой возвращен первоначальный облик. В октябре 2010 года ОАО "Российские железные дороги", ГМЗ "Царское Село", ОАО "РЖД" и БФ "Транссоюз" подписали Соглашение о сотрудничестве в поддержке музея-заповедника.
Главной целью документа стала реставрация уникального памятника XVIII века Агатовых комнат павильона "Холодная баня" архитектора Камерона в Екатерининском парке. В рамках соглашения реставрации подлежат 7 интерьеров Агатовых комнат: Агатовый кабинет, Библиотека, Лестница, Большой зал, Яшмовый кабинет, Овальный зал и Кабинетец. Кроме этого, в рамках сотрудничества запланировано проведение различных музейных проектов. В церемонии открытия участвовали замминистра культуры России Андрей Бусыгин, президент ОАО "РЖД" Владимир Якунин и руководитель ГМЗ "Царское Село" Ольга Таратынова.
Агатовые комнаты – это единственные апартаменты Екатерины Великой в Царском Селе, уникальная отделка которых сохранилась до настоящего момента и не имеет аналогов ни в Европе, ни в России.